В университете дружбы народов имени академика А.Куатбекова функционирует система менеджмента качества в соответствии с МС ИСО 9001, которая успешно сертифицирована (ISO 9001:2008) 24 января 2017 года Ассоциацией по сертификации «Русский Регистр».
2018 году прошел очередной инспекционный аудит Внешнего аудита по новой версии ІSО-9001:2015 Ассоциация по сертификации «Русский Регистр» (на соответствие международным стандартам качества);
Политика в области обеспечения качества образовательной программы направлена на построение собственной системы управления качеством образования, в направлении обеспечения высокого качества образовательных услуг, через ориентированность на обучающегося, в соответствии с правовыми нормами и требованиями работодателей. Деятельность университета по всем направлениям осуществляется согласно требований МОН РК.